Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmem200cJ3QK46 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem200cJ3QK46 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem200cJ3QK46 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem200cJ3QK46 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem200cJ3QK46 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem200cJ3QK46 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem200cJ3QK46 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem200cJ3QK46 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem200cJ3QK46 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem200cJ3QK46 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem200cJ3QK46 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem200cJ3QK46 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem200cJ3QK46 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem200cJ3QK46 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem200cJ3QK46 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem200cJ3QK46 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem200cJ3QK46 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem200cJ3QK46 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem200cJ3QK46 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem200cJ3QK46 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem200cJ3QK46 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem200cJ3QK46 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem200cJ3QK46 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem200cJ3QK46 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem200cJ3QK46 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem200cJ3QK46 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem200cJ3QK46 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem200cJ3QK46 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem200cJ3QK46 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem200cJ3QK46 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem200cJ3QK46 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem200cJ3QK46 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem200cJ3QK46 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem200cJ3QK46 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem200cJ3QK46 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem200cJ3QK46 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem200cJ3QK46 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem200cJ3QK46 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.7 ms