Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP9

Scgb2a2, Secretoglobin, family 2A, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2a2J3KMP9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scgb2a2J3KMP9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scgb2a2J3KMP9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scgb2a2J3KMP9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scgb2a2J3KMP9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scgb2a2J3KMP9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scgb2a2J3KMP9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scgb2a2J3KMP9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scgb2a2J3KMP9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scgb2a2J3KMP9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scgb2a2J3KMP9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scgb2a2J3KMP9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scgb2a2J3KMP9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scgb2a2J3KMP9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scgb2a2J3KMP9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scgb2a2J3KMP9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scgb2a2J3KMP9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scgb2a2J3KMP9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scgb2a2J3KMP9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms