Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G3

Opcml, MCG9827, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OpcmlG5E8G3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OpcmlG5E8G3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OpcmlG5E8G3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OpcmlG5E8G3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OpcmlG5E8G3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OpcmlG5E8G3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OpcmlG5E8G3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms