Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Colca2F8VPY8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Colca2F8VPY8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Colca2F8VPY8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Colca2F8VPY8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Colca2F8VPY8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Colca2F8VPY8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Colca2F8VPY8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Colca2F8VPY8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Colca2F8VPY8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Colca2F8VPY8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Colca2F8VPY8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Colca2F8VPY8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Colca2F8VPY8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Colca2F8VPY8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colca2F8VPY8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colca2F8VPY8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Colca2F8VPY8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Colca2F8VPY8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Colca2F8VPY8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Colca2F8VPY8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Colca2F8VPY8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Colca2F8VPY8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Colca2F8VPY8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Colca2F8VPY8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colca2F8VPY8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colca2F8VPY8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Colca2F8VPY8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Colca2F8VPY8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Colca2F8VPY8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Colca2F8VPY8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Colca2F8VPY8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Colca2F8VPY8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Colca2F8VPY8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Colca2F8VPY8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Colca2F8VPY8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colca2F8VPY8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colca2F8VPY8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colca2F8VPY8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Colca2F8VPY8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Colca2F8VPY8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Colca2F8VPY8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Colca2F8VPY8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Colca2F8VPY8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Colca2F8VPY8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Colca2F8VPY8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Colca2F8VPY8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Colca2F8VPY8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Colca2F8VPY8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Colca2F8VPY8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Colca2F8VPY8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Colca2F8VPY8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colca2F8VPY8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colca2F8VPY8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colca2F8VPY8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colca2F8VPY8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Colca2F8VPY8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Colca2F8VPY8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Colca2F8VPY8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Colca2F8VPY8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Colca2F8VPY8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Colca2F8VPY8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Colca2F8VPY8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms