Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm21977F6U3N7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm21977F6U3N7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm21977F6U3N7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm21977F6U3N7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21977F6U3N7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms