Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa35E9QLQ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa35E9QLQ1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa35E9QLQ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa35E9QLQ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms