Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm20518E9Q548 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20518E9Q548 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20518E9Q548 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20518E9Q548 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20518E9Q548 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm20518E9Q548 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm20518E9Q548 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm20518E9Q548 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm20518E9Q548 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20518E9Q548 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20518E9Q548 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20518E9Q548 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20518E9Q548 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm20518E9Q548 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20518E9Q548 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm20518E9Q548 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm20518E9Q548 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm20518E9Q548 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm20518E9Q548 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm20518E9Q548 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm20518E9Q548 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm20518E9Q548 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm20518E9Q548 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20518E9Q548 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20518E9Q548 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20518E9Q548 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20518E9Q548 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm20518E9Q548 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20518E9Q548 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20518E9Q548 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms