Protein–RNA interactions for Protein: E9Q422

A530032D15Rik, RIKEN cDNA A530032D15Rik gene, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530032D15RikE9Q422 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A530032D15RikE9Q422 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A530032D15RikE9Q422 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A530032D15RikE9Q422 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A530032D15RikE9Q422 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A530032D15RikE9Q422 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A530032D15RikE9Q422 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A530032D15RikE9Q422 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A530032D15RikE9Q422 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A530032D15RikE9Q422 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A530032D15RikE9Q422 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A530032D15RikE9Q422 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms