Protein–RNA interactions for Protein: E9Q289

Acbd4, Acyl-Coenzyme A-binding domain-containing 4, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd4E9Q289 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Acbd4E9Q289 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Acbd4E9Q289 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Acbd4E9Q289 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Acbd4E9Q289 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Acbd4E9Q289 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Acbd4E9Q289 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Acbd4E9Q289 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acbd4E9Q289 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acbd4E9Q289 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acbd4E9Q289 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acbd4E9Q289 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acbd4E9Q289 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acbd4E9Q289 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acbd4E9Q289 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acbd4E9Q289 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acbd4E9Q289 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acbd4E9Q289 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acbd4E9Q289 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acbd4E9Q289 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Acbd4E9Q289 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acbd4E9Q289 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acbd4E9Q289 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acbd4E9Q289 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acbd4E9Q289 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Acbd4E9Q289 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Acbd4E9Q289 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Acbd4E9Q289 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Acbd4E9Q289 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Acbd4E9Q289 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Acbd4E9Q289 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms