Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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