Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pdzd2E9Q1M1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pdzd2E9Q1M1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdzd2E9Q1M1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pdzd2E9Q1M1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.7 ms