Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N2

Ptprh, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprhE9Q0N2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprhE9Q0N2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprhE9Q0N2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprhE9Q0N2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
PtprhE9Q0N2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprhE9Q0N2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprhE9Q0N2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprhE9Q0N2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprhE9Q0N2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprhE9Q0N2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprhE9Q0N2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprhE9Q0N2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprhE9Q0N2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprhE9Q0N2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprhE9Q0N2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprhE9Q0N2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprhE9Q0N2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprhE9Q0N2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprhE9Q0N2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprhE9Q0N2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprhE9Q0N2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprhE9Q0N2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprhE9Q0N2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprhE9Q0N2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprhE9Q0N2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprhE9Q0N2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprhE9Q0N2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprhE9Q0N2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprhE9Q0N2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprhE9Q0N2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprhE9Q0N2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprhE9Q0N2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprhE9Q0N2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms