Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm20425E9Q035 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm20425E9Q035 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm20425E9Q035 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm20425E9Q035 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm20425E9Q035 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm20425E9Q035 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm20425E9Q035 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm20425E9Q035 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gm20425E9Q035 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gm20425E9Q035 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm20425E9Q035 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm20425E9Q035 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm20425E9Q035 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gm20425E9Q035 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm20425E9Q035 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm20425E9Q035 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gm20425E9Q035 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gm20425E9Q035 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm20425E9Q035 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm20425E9Q035 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm20425E9Q035 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm20425E9Q035 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm20425E9Q035 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm20425E9Q035 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm20425E9Q035 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm20425E9Q035 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm20425E9Q035 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm20425E9Q035 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm20425E9Q035 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm20425E9Q035 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm20425E9Q035 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm20425E9Q035 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm20425E9Q035 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gm20425E9Q035 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm20425E9Q035 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm20425E9Q035 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm20425E9Q035 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm20425E9Q035 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm20425E9Q035 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm20425E9Q035 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm20425E9Q035 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm20425E9Q035 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm20425E9Q035 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm20425E9Q035 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm20425E9Q035 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm20425E9Q035 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm20425E9Q035 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gm20425E9Q035 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gm20425E9Q035 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm20425E9Q035 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm20425E9Q035 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm20425E9Q035 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm20425E9Q035 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm20425E9Q035 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm20425E9Q035 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm20425E9Q035 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm20425E9Q035 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm20425E9Q035 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm20425E9Q035 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm20425E9Q035 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm20425E9Q035 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm20425E9Q035 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm20425E9Q035 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gm20425E9Q035 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm20425E9Q035 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm20425E9Q035 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm20425E9Q035 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm20425E9Q035 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm20425E9Q035 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm20425E9Q035 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm20425E9Q035 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm20425E9Q035 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm20425E9Q035 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm20425E9Q035 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm20425E9Q035 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm20425E9Q035 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm20425E9Q035 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm20425E9Q035 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm20425E9Q035 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms