Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Brd1E9PZ26 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Brd1E9PZ26 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Brd1E9PZ26 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Brd1E9PZ26 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Brd1E9PZ26 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Brd1E9PZ26 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Brd1E9PZ26 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Brd1E9PZ26 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Brd1E9PZ26 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Brd1E9PZ26 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Brd1E9PZ26 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Brd1E9PZ26 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Brd1E9PZ26 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Brd1E9PZ26 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Brd1E9PZ26 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Brd1E9PZ26 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Brd1E9PZ26 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Brd1E9PZ26 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Brd1E9PZ26 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Brd1E9PZ26 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Brd1E9PZ26 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Brd1E9PZ26 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Brd1E9PZ26 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Brd1E9PZ26 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Brd1E9PZ26 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Brd1E9PZ26 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Brd1E9PZ26 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Brd1E9PZ26 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Brd1E9PZ26 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Brd1E9PZ26 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Brd1E9PZ26 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Brd1E9PZ26 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Brd1E9PZ26 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Brd1E9PZ26 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Brd1E9PZ26 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Brd1E9PZ26 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Brd1E9PZ26 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Brd1E9PZ26 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Brd1E9PZ26 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Brd1E9PZ26 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Brd1E9PZ26 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Brd1E9PZ26 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Brd1E9PZ26 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Brd1E9PZ26 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Brd1E9PZ26 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Brd1E9PZ26 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Brd1E9PZ26 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Brd1E9PZ26 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Brd1E9PZ26 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Brd1E9PZ26 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Brd1E9PZ26 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Brd1E9PZ26 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Brd1E9PZ26 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Brd1E9PZ26 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Brd1E9PZ26 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Brd1E9PZ26 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brd1E9PZ26 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brd1E9PZ26 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brd1E9PZ26 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brd1E9PZ26 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Brd1E9PZ26 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Brd1E9PZ26 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms