Protein–RNA interactions for Protein: E9PXX9

Slc28a1, Sodium/nucleoside cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a1E9PXX9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc28a1E9PXX9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc28a1E9PXX9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc28a1E9PXX9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc28a1E9PXX9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc28a1E9PXX9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc28a1E9PXX9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc28a1E9PXX9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc28a1E9PXX9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc28a1E9PXX9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc28a1E9PXX9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a1E9PXX9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a1E9PXX9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a1E9PXX9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a1E9PXX9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a1E9PXX9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc28a1E9PXX9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc28a1E9PXX9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc28a1E9PXX9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc28a1E9PXX9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc28a1E9PXX9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc28a1E9PXX9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc28a1E9PXX9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc28a1E9PXX9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc28a1E9PXX9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc28a1E9PXX9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc28a1E9PXX9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc28a1E9PXX9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc28a1E9PXX9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc28a1E9PXX9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc28a1E9PXX9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc28a1E9PXX9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc28a1E9PXX9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms