Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r177E9PXM3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r177E9PXM3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r177E9PXM3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r177E9PXM3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r177E9PXM3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r177E9PXM3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r177E9PXM3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r177E9PXM3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r177E9PXM3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r177E9PXM3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r177E9PXM3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r177E9PXM3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r177E9PXM3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r177E9PXM3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r177E9PXM3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r177E9PXM3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r177E9PXM3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r177E9PXM3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r177E9PXM3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r177E9PXM3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r177E9PXM3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r177E9PXM3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r177E9PXM3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r177E9PXM3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r177E9PXM3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vmn1r177E9PXM3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r177E9PXM3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r177E9PXM3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r177E9PXM3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r177E9PXM3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r177E9PXM3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r177E9PXM3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r177E9PXM3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r177E9PXM3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r177E9PXM3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r177E9PXM3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Vmn1r177E9PXM3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r177E9PXM3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r177E9PXM3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r177E9PXM3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r177E9PXM3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r177E9PXM3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms