Protein–RNA interactions for Protein: E9PWS4

AU018091, Expressed sequence AU018091, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU018091E9PWS4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU018091E9PWS4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU018091E9PWS4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU018091E9PWS4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU018091E9PWS4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU018091E9PWS4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU018091E9PWS4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU018091E9PWS4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU018091E9PWS4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU018091E9PWS4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU018091E9PWS4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU018091E9PWS4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU018091E9PWS4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU018091E9PWS4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU018091E9PWS4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU018091E9PWS4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU018091E9PWS4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU018091E9PWS4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU018091E9PWS4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU018091E9PWS4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU018091E9PWS4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU018091E9PWS4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU018091E9PWS4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU018091E9PWS4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU018091E9PWS4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AU018091E9PWS4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AU018091E9PWS4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AU018091E9PWS4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AU018091E9PWS4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AU018091E9PWS4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AU018091E9PWS4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AU018091E9PWS4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AU018091E9PWS4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AU018091E9PWS4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AU018091E9PWS4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AU018091E9PWS4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AU018091E9PWS4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AU018091E9PWS4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU018091E9PWS4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU018091E9PWS4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU018091E9PWS4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU018091E9PWS4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AU018091E9PWS4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AU018091E9PWS4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AU018091E9PWS4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU018091E9PWS4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AU018091E9PWS4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU018091E9PWS4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU018091E9PWS4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU018091E9PWS4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU018091E9PWS4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU018091E9PWS4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AU018091E9PWS4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU018091E9PWS4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU018091E9PWS4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU018091E9PWS4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU018091E9PWS4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU018091E9PWS4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU018091E9PWS4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU018091E9PWS4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU018091E9PWS4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AU018091E9PWS4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU018091E9PWS4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU018091E9PWS4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU018091E9PWS4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AU018091E9PWS4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AU018091E9PWS4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AU018091E9PWS4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AU018091E9PWS4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU018091E9PWS4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU018091E9PWS4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AU018091E9PWS4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU018091E9PWS4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AU018091E9PWS4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AU018091E9PWS4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AU018091E9PWS4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms