Protein–RNA interactions for Protein: E9PUW8

Ccdc24, Coiled-coil domain-containing 24, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc24E9PUW8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc24E9PUW8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc24E9PUW8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc24E9PUW8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc24E9PUW8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc24E9PUW8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc24E9PUW8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms