Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Syde2E9PUP1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Syde2E9PUP1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Syde2E9PUP1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Syde2E9PUP1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Syde2E9PUP1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Syde2E9PUP1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Syde2E9PUP1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Syde2E9PUP1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Syde2E9PUP1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Syde2E9PUP1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Syde2E9PUP1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Syde2E9PUP1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Syde2E9PUP1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Syde2E9PUP1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Syde2E9PUP1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Syde2E9PUP1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Syde2E9PUP1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Syde2E9PUP1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Syde2E9PUP1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Syde2E9PUP1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Syde2E9PUP1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Syde2E9PUP1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Syde2E9PUP1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Syde2E9PUP1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Syde2E9PUP1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Syde2E9PUP1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Syde2E9PUP1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Syde2E9PUP1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Syde2E9PUP1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Syde2E9PUP1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Syde2E9PUP1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Syde2E9PUP1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Syde2E9PUP1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Syde2E9PUP1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Syde2E9PUP1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Syde2E9PUP1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Syde2E9PUP1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Syde2E9PUP1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Syde2E9PUP1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Syde2E9PUP1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Syde2E9PUP1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Syde2E9PUP1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Syde2E9PUP1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Syde2E9PUP1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Syde2E9PUP1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Syde2E9PUP1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Syde2E9PUP1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Syde2E9PUP1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Syde2E9PUP1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Syde2E9PUP1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Syde2E9PUP1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Syde2E9PUP1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Syde2E9PUP1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Syde2E9PUP1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Syde2E9PUP1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Syde2E9PUP1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Syde2E9PUP1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Syde2E9PUP1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Syde2E9PUP1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Syde2E9PUP1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Syde2E9PUP1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Syde2E9PUP1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Syde2E9PUP1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Syde2E9PUP1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Syde2E9PUP1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Syde2E9PUP1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Syde2E9PUP1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Syde2E9PUP1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Syde2E9PUP1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Syde2E9PUP1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Syde2E9PUP1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Syde2E9PUP1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Syde2E9PUP1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Syde2E9PUP1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Syde2E9PUP1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Syde2E9PUP1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Syde2E9PUP1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Syde2E9PUP1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Syde2E9PUP1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Syde2E9PUP1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Syde2E9PUP1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Syde2E9PUP1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Syde2E9PUP1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Syde2E9PUP1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Syde2E9PUP1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Syde2E9PUP1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Syde2E9PUP1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Syde2E9PUP1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Syde2E9PUP1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Syde2E9PUP1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Syde2E9PUP1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Syde2E9PUP1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Syde2E9PUP1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Syde2E9PUP1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Syde2E9PUP1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Syde2E9PUP1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Syde2E9PUP1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Syde2E9PUP1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Syde2E9PUP1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms