Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt2E9PUL5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrt2E9PUL5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt2E9PUL5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt2E9PUL5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrt2E9PUL5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrt2E9PUL5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrt2E9PUL5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrt2E9PUL5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prrt2E9PUL5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrt2E9PUL5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrt2E9PUL5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prrt2E9PUL5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt2E9PUL5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt2E9PUL5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prrt2E9PUL5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prrt2E9PUL5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prrt2E9PUL5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prrt2E9PUL5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt2E9PUL5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt2E9PUL5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt2E9PUL5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt2E9PUL5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt2E9PUL5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt2E9PUL5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt2E9PUL5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt2E9PUL5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrt2E9PUL5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrt2E9PUL5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrt2E9PUL5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrt2E9PUL5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrt2E9PUL5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrt2E9PUL5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrt2E9PUL5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrt2E9PUL5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrt2E9PUL5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrt2E9PUL5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrt2E9PUL5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prrt2E9PUL5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Prrt2E9PUL5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrt2E9PUL5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrt2E9PUL5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prrt2E9PUL5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrt2E9PUL5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prrt2E9PUL5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrt2E9PUL5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prrt2E9PUL5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prrt2E9PUL5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prrt2E9PUL5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrt2E9PUL5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrt2E9PUL5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrt2E9PUL5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrt2E9PUL5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrt2E9PUL5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrt2E9PUL5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrt2E9PUL5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms