Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc8D3YZV8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc8D3YZV8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc8D3YZV8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc8D3YZV8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc8D3YZV8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc8D3YZV8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc8D3YZV8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc8D3YZV8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc8D3YZV8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc8D3YZV8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc8D3YZV8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc8D3YZV8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc8D3YZV8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc8D3YZV8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc8D3YZV8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc8D3YZV8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc8D3YZV8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc8D3YZV8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc8D3YZV8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc8D3YZV8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc8D3YZV8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc8D3YZV8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc8D3YZV8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc8D3YZV8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc8D3YZV8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc8D3YZV8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc8D3YZV8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc8D3YZV8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc8D3YZV8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc8D3YZV8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc8D3YZV8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc8D3YZV8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc8D3YZV8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc8D3YZV8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc8D3YZV8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc8D3YZV8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc8D3YZV8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc8D3YZV8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc8D3YZV8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc8D3YZV8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc8D3YZV8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc8D3YZV8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc8D3YZV8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc8D3YZV8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc8D3YZV8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc8D3YZV8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc8D3YZV8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc8D3YZV8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc8D3YZV8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms