Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm6685D3YYP3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm6685D3YYP3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm6685D3YYP3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm6685D3YYP3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm6685D3YYP3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm6685D3YYP3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm6685D3YYP3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm6685D3YYP3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm6685D3YYP3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm6685D3YYP3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm6685D3YYP3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm6685D3YYP3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm6685D3YYP3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm6685D3YYP3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm6685D3YYP3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm6685D3YYP3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm6685D3YYP3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm6685D3YYP3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm6685D3YYP3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms