Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx8D3YU81 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx8D3YU81 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx8D3YU81 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx8D3YU81 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rfx8D3YU81 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx8D3YU81 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rfx8D3YU81 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx8D3YU81 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rfx8D3YU81 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx8D3YU81 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx8D3YU81 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rfx8D3YU81 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfx8D3YU81 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx8D3YU81 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx8D3YU81 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfx8D3YU81 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfx8D3YU81 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfx8D3YU81 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfx8D3YU81 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rfx8D3YU81 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rfx8D3YU81 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rfx8D3YU81 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfx8D3YU81 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfx8D3YU81 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfx8D3YU81 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfx8D3YU81 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfx8D3YU81 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfx8D3YU81 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfx8D3YU81 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx8D3YU81 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx8D3YU81 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx8D3YU81 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx8D3YU81 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx8D3YU81 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx8D3YU81 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfx8D3YU81 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfx8D3YU81 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx8D3YU81 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx8D3YU81 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx8D3YU81 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx8D3YU81 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx8D3YU81 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx8D3YU81 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfx8D3YU81 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfx8D3YU81 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx8D3YU81 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx8D3YU81 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx8D3YU81 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx8D3YU81 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx8D3YU81 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfx8D3YU81 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfx8D3YU81 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rfx8D3YU81 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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