Protein–RNA interactions for Protein: B9EJU1

Gm1141, Gene model 1141, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1141B9EJU1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm1141B9EJU1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm1141B9EJU1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm1141B9EJU1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm1141B9EJU1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm1141B9EJU1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm1141B9EJU1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm1141B9EJU1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm1141B9EJU1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm1141B9EJU1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm1141B9EJU1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm1141B9EJU1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm1141B9EJU1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm1141B9EJU1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm1141B9EJU1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm1141B9EJU1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm1141B9EJU1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm1141B9EJU1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm1141B9EJU1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm1141B9EJU1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm1141B9EJU1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm1141B9EJU1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm1141B9EJU1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm1141B9EJU1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm1141B9EJU1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm1141B9EJU1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm1141B9EJU1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm1141B9EJU1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1141B9EJU1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1141B9EJU1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1141B9EJU1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1141B9EJU1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1141B9EJU1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm1141B9EJU1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1141B9EJU1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1141B9EJU1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1141B9EJU1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm1141B9EJU1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1141B9EJU1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm1141B9EJU1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm1141B9EJU1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm1141B9EJU1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms