Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf3B2RQG2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf3B2RQG2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf3B2RQG2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf3B2RQG2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf3B2RQG2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf3B2RQG2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf3B2RQG2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf3B2RQG2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Phf3B2RQG2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Phf3B2RQG2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phf3B2RQG2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phf3B2RQG2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Phf3B2RQG2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phf3B2RQG2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phf3B2RQG2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phf3B2RQG2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf3B2RQG2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf3B2RQG2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf3B2RQG2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf3B2RQG2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf3B2RQG2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phf3B2RQG2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf3B2RQG2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phf3B2RQG2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf3B2RQG2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf3B2RQG2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf3B2RQG2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf3B2RQG2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf3B2RQG2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf3B2RQG2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf3B2RQG2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf3B2RQG2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf3B2RQG2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf3B2RQG2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf3B2RQG2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf3B2RQG2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf3B2RQG2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf3B2RQG2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phf3B2RQG2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phf3B2RQG2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf3B2RQG2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf3B2RQG2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf3B2RQG2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf3B2RQG2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf3B2RQG2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf3B2RQG2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf3B2RQG2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf3B2RQG2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf3B2RQG2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf3B2RQG2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf3B2RQG2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.4 ms