Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms