Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nipsnap3aB1AWZ3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nipsnap3aB1AWZ3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nipsnap3aB1AWZ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nipsnap3aB1AWZ3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms