Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Prr29B1ARI9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Prr29B1ARI9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Prr29B1ARI9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Prr29B1ARI9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Prr29B1ARI9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Prr29B1ARI9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Prr29B1ARI9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Prr29B1ARI9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Prr29B1ARI9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Prr29B1ARI9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Prr29B1ARI9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Prr29B1ARI9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Prr29B1ARI9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Prr29B1ARI9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Prr29B1ARI9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Prr29B1ARI9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Prr29B1ARI9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Prr29B1ARI9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Prr29B1ARI9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Prr29B1ARI9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Prr29B1ARI9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Prr29B1ARI9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Prr29B1ARI9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Prr29B1ARI9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Prr29B1ARI9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Prr29B1ARI9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Prr29B1ARI9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Prr29B1ARI9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prr29B1ARI9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prr29B1ARI9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prr29B1ARI9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prr29B1ARI9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prr29B1ARI9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Prr29B1ARI9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Prr29B1ARI9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Prr29B1ARI9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Prr29B1ARI9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Prr29B1ARI9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Prr29B1ARI9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Prr29B1ARI9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Prr29B1ARI9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Prr29B1ARI9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Prr29B1ARI9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Prr29B1ARI9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Prr29B1ARI9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Prr29B1ARI9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Prr29B1ARI9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prr29B1ARI9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prr29B1ARI9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prr29B1ARI9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prr29B1ARI9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Prr29B1ARI9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prr29B1ARI9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Prr29B1ARI9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prr29B1ARI9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Prr29B1ARI9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Prr29B1ARI9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prr29B1ARI9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prr29B1ARI9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Prr29B1ARI9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Prr29B1ARI9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Prr29B1ARI9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prr29B1ARI9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prr29B1ARI9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prr29B1ARI9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prr29B1ARI9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prr29B1ARI9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prr29B1ARI9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prr29B1ARI9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prr29B1ARI9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prr29B1ARI9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Prr29B1ARI9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Prr29B1ARI9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prr29B1ARI9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Prr29B1ARI9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Prr29B1ARI9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prr29B1ARI9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms