Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Supt3B0QZW4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt3B0QZW4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Supt3B0QZW4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt3B0QZW4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt3B0QZW4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt3B0QZW4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt3B0QZW4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Supt3B0QZW4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt3B0QZW4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt3B0QZW4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt3B0QZW4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Supt3B0QZW4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Supt3B0QZW4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Supt3B0QZW4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Supt3B0QZW4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Supt3B0QZW4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Supt3B0QZW4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Supt3B0QZW4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Supt3B0QZW4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Supt3B0QZW4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Supt3B0QZW4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Supt3B0QZW4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt3B0QZW4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt3B0QZW4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt3B0QZW4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt3B0QZW4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt3B0QZW4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt3B0QZW4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt3B0QZW4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt3B0QZW4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt3B0QZW4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt3B0QZW4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt3B0QZW4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt3B0QZW4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt3B0QZW4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt3B0QZW4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt3B0QZW4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt3B0QZW4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt3B0QZW4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms