Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm6880A3KG45 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6880A3KG45 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6880A3KG45 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm6880A3KG45 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6880A3KG45 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm6880A3KG45 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm6880A3KG45 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm6880A3KG45 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6880A3KG45 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6880A3KG45 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6880A3KG45 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6880A3KG45 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6880A3KG45 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6880A3KG45 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6880A3KG45 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6880A3KG45 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6880A3KG45 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6880A3KG45 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6880A3KG45 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm6880A3KG45 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6880A3KG45 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6880A3KG45 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm6880A3KG45 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6880A3KG45 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6880A3KG45 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm6880A3KG45 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm6880A3KG45 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6880A3KG45 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6880A3KG45 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6880A3KG45 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6880A3KG45 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm6880A3KG45 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm6880A3KG45 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm6880A3KG45 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6880A3KG45 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6880A3KG45 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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