Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fibcd1A2AV25 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fibcd1A2AV25 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fibcd1A2AV25 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fibcd1A2AV25 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fibcd1A2AV25 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fibcd1A2AV25 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fibcd1A2AV25 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fibcd1A2AV25 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fibcd1A2AV25 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fibcd1A2AV25 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fibcd1A2AV25 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fibcd1A2AV25 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fibcd1A2AV25 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fibcd1A2AV25 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fibcd1A2AV25 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fibcd1A2AV25 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fibcd1A2AV25 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fibcd1A2AV25 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fibcd1A2AV25 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fibcd1A2AV25 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fibcd1A2AV25 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fibcd1A2AV25 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fibcd1A2AV25 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fibcd1A2AV25 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fibcd1A2AV25 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fibcd1A2AV25 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fibcd1A2AV25 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fibcd1A2AV25 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fibcd1A2AV25 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fibcd1A2AV25 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fibcd1A2AV25 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fibcd1A2AV25 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fibcd1A2AV25 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fibcd1A2AV25 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fibcd1A2AV25 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Fibcd1A2AV25 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fibcd1A2AV25 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fibcd1A2AV25 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fibcd1A2AV25 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fibcd1A2AV25 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fibcd1A2AV25 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fibcd1A2AV25 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fibcd1A2AV25 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fibcd1A2AV25 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fibcd1A2AV25 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fibcd1A2AV25 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fibcd1A2AV25 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fibcd1A2AV25 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fibcd1A2AV25 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms