Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ambra1A2AH22 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ambra1A2AH22 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ambra1A2AH22 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ambra1A2AH22 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ambra1A2AH22 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ambra1A2AH22 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ambra1A2AH22 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ambra1A2AH22 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ambra1A2AH22 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ambra1A2AH22 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ambra1A2AH22 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ambra1A2AH22 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ambra1A2AH22 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ambra1A2AH22 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ambra1A2AH22 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ambra1A2AH22 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ambra1A2AH22 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ambra1A2AH22 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ambra1A2AH22 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ambra1A2AH22 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ambra1A2AH22 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ambra1A2AH22 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ambra1A2AH22 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ambra1A2AH22 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ambra1A2AH22 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ambra1A2AH22 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ambra1A2AH22 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ambra1A2AH22 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ambra1A2AH22 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Ambra1A2AH22 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ambra1A2AH22 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ambra1A2AH22 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ambra1A2AH22 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ambra1A2AH22 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ambra1A2AH22 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ambra1A2AH22 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ambra1A2AH22 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ambra1A2AH22 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ambra1A2AH22 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ambra1A2AH22 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ambra1A2AH22 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ambra1A2AH22 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ambra1A2AH22 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ambra1A2AH22 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ambra1A2AH22 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ambra1A2AH22 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ambra1A2AH22 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ambra1A2AH22 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ambra1A2AH22 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ambra1A2AH22 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ambra1A2AH22 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ambra1A2AH22 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ambra1A2AH22 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ambra1A2AH22 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ambra1A2AH22 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ambra1A2AH22 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ambra1A2AH22 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ambra1A2AH22 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ambra1A2AH22 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ambra1A2AH22 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ambra1A2AH22 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ambra1A2AH22 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Ambra1A2AH22 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ambra1A2AH22 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ambra1A2AH22 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ambra1A2AH22 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ambra1A2AH22 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ambra1A2AH22 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ambra1A2AH22 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ambra1A2AH22 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ambra1A2AH22 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ambra1A2AH22 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ambra1A2AH22 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ambra1A2AH22 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ambra1A2AH22 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ambra1A2AH22 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Ambra1A2AH22 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Ambra1A2AH22 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ambra1A2AH22 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms