Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbf1A2A870 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbf1A2A870 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbf1A2A870 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbf1A2A870 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fbf1A2A870 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbf1A2A870 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbf1A2A870 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbf1A2A870 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbf1A2A870 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fbf1A2A870 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbf1A2A870 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbf1A2A870 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbf1A2A870 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbf1A2A870 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fbf1A2A870 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Fbf1A2A870 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbf1A2A870 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fbf1A2A870 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbf1A2A870 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fbf1A2A870 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fbf1A2A870 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fbf1A2A870 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbf1A2A870 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbf1A2A870 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbf1A2A870 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fbf1A2A870 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbf1A2A870 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fbf1A2A870 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fbf1A2A870 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbf1A2A870 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fbf1A2A870 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fbf1A2A870 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fbf1A2A870 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fbf1A2A870 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fbf1A2A870 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fbf1A2A870 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fbf1A2A870 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fbf1A2A870 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Fbf1A2A870 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fbf1A2A870 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fbf1A2A870 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fbf1A2A870 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fbf1A2A870 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fbf1A2A870 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fbf1A2A870 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Fbf1A2A870 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fbf1A2A870 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fbf1A2A870 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fbf1A2A870 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms