Protein–RNA interactions for Protein: A0A1D5RMN0

Tnip3, TNFAIP3-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip3A0A1D5RMN0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnip3A0A1D5RMN0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnip3A0A1D5RMN0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnip3A0A1D5RMN0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnip3A0A1D5RMN0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnip3A0A1D5RMN0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnip3A0A1D5RMN0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnip3A0A1D5RMN0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnip3A0A1D5RMN0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnip3A0A1D5RMN0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnip3A0A1D5RMN0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnip3A0A1D5RMN0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnip3A0A1D5RMN0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnip3A0A1D5RMN0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnip3A0A1D5RMN0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnip3A0A1D5RMN0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnip3A0A1D5RMN0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnip3A0A1D5RMN0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnip3A0A1D5RMN0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms