Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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