Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1520401A03RikA0A0J9YVH6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1520401A03RikA0A0J9YVH6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms