Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B020011L13RikA0A087WQI7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B020011L13RikA0A087WQI7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B020011L13RikA0A087WQI7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B020011L13RikA0A087WQI7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B020011L13RikA0A087WQI7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B020011L13RikA0A087WQI7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B020011L13RikA0A087WQI7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B020011L13RikA0A087WQI7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B020011L13RikA0A087WQI7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B020011L13RikA0A087WQI7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B020011L13RikA0A087WQI7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B020011L13RikA0A087WQI7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B020011L13RikA0A087WQI7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
B020011L13RikA0A087WQI7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B020011L13RikA0A087WQI7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B020011L13RikA0A087WQI7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B020011L13RikA0A087WQI7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B020011L13RikA0A087WQI7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B020011L13RikA0A087WQI7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B020011L13RikA0A087WQI7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
B020011L13RikA0A087WQI7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
B020011L13RikA0A087WQI7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
B020011L13RikA0A087WQI7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
B020011L13RikA0A087WQI7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
B020011L13RikA0A087WQI7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
B020011L13RikA0A087WQI7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
B020011L13RikA0A087WQI7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms