Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm28510A0A087WP28 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm28510A0A087WP28 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28510A0A087WP28 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28510A0A087WP28 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28510A0A087WP28 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28510A0A087WP28 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms