Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyp2c55Q9D816 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyp2c55Q9D816 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms