Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spns3Q9D232 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms