Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc8Q9CYA6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zcchc8Q9CYA6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms