Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Nkx6-3Q3UHX8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nkx6-3Q3UHX8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Nkx6-3Q3UHX8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Nkx6-3Q3UHX8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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