Protein–RNA interactions for Protein: Q3E7A2

YER078W-A, Uncharacterized protein YER078W-A, yeastyeast

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YER078W-AQ3E7A2 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.59□□□□□ -2.31
YER078W-AQ3E7A2 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.59□□□□□ -2.31
YER078W-AQ3E7A2 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt0.58□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 IMT4tM(CAU)E 72 nt0.58□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 IMT3tM(CAU)J3 72 nt0.58□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 IMT1tM(CAU)O1 72 nt0.58□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 IMT2tM(CAU)P 72 nt0.58□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 MYO1YHR023W 5787 nt0.57□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt0.56□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 HUG1YML058W-A 207 nt0.56□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 YBR099CYBR099C 384 nt0.56□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 PAU10YDR542W 363 nt0.55□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 PAU12YGR294W 363 nt0.55□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.55□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt0.55□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 PAU24YBR301W 363 nt0.55□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 NIP1YMR309C 2439 nt0.55□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 RPS26AYGL189C 360 nt0.54□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 YNL205CYNL205C 423 nt0.54□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.54□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 UTP10YJL109C 5310 nt0.53□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.53□□□□□ -2.32
YER078W-AQ3E7A2 LTE1YAL024C 4308 nt0.52□□□□□ -2.33
YER078W-AQ3E7A2 ORC3YLL004W 1851 nt0.5□□□□□ -2.33
YER078W-AQ3E7A2 SBH1YER087C-B 249 nt0.49□□□□□ -2.33
YER078W-AQ3E7A2 BIR1YJR089W 2865 nt0.48□□□□□ -2.33
YER078W-AQ3E7A2 BEM2YER155C 6504 nt0.48□□□□□ -2.33
YER078W-AQ3E7A2 YNL266WYNL266W 420 nt0.47□□□□□ -2.33
YER078W-AQ3E7A2 DOP1YDR141C 5097 nt0.47□□□□□ -2.33
YER078W-AQ3E7A2 BUL2YML111W 2763 nt0.46□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt0.45□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt0.45□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt0.45□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt0.45□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt0.45□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt0.45□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt0.45□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.45□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 PMP2YEL017C-A 132 nt0.44□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 ANS1YHR126C 480 nt0.44□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 MBB1YJL199C 327 nt0.44□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 RPM2YML091C 3609 nt0.44□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 MLP1YKR095W 5628 nt0.44□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 STF2YGR008C 255 nt0.43□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 YBR178WYBR178W 375 nt0.43□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 SIP4YJL089W 2490 nt0.43□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 RCO1YMR075W 2055 nt0.42□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 SEC10YLR166C 2616 nt0.42□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 snR69snR69 101 nt0.42□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt0.42□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 MEC1YBR136W 7107 nt0.42□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 EST1YLR233C 2100 nt0.41□□□□□ -2.34
YER078W-AQ3E7A2 Q0143Q0143 153 nt0.4□□□□□ -2.35
YER078W-AQ3E7A2 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.39□□□□□ -2.35
YER078W-AQ3E7A2 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.38□□□□□ -2.35
YER078W-AQ3E7A2 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.37□□□□□ -2.35
YER078W-AQ3E7A2 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.37□□□□□ -2.35
YER078W-AQ3E7A2 PAU4YLR461W 363 nt0.37□□□□□ -2.35
YER078W-AQ3E7A2 snR85snR85 171 nt0.36□□□□□ -2.35
YER078W-AQ3E7A2 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt0.36□□□□□ -2.35
YER078W-AQ3E7A2 RDS3YPR094W 324 nt0.36□□□□□ -2.35
YER078W-AQ3E7A2 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.35□□□□□ -2.35
YER078W-AQ3E7A2 FIG2YCR089W 4830 nt0.35□□□□□ -2.35
YER078W-AQ3E7A2 YMR160WYMR160W 2451 nt0.35□□□□□ -2.35
YER078W-AQ3E7A2 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.33□□□□□ -2.36
YER078W-AQ3E7A2 NUP192YJL039C 5052 nt0.33□□□□□ -2.36
YER078W-AQ3E7A2 snR61snR61 90 nt0.3□□□□□ -2.36
YER078W-AQ3E7A2 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.29□□□□□ -2.36
YER078W-AQ3E7A2 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.28□□□□□ -2.36
YER078W-AQ3E7A2 AI1Q0050 2505 nt0.27□□□□□ -2.37
YER078W-AQ3E7A2 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.26□□□□□ -2.37
YER078W-AQ3E7A2 IQG1YPL242C 4488 nt0.26□□□□□ -2.37
YER078W-AQ3E7A2 TFB5YDR079C-A 219 nt0.25□□□□□ -2.37
YER078W-AQ3E7A2 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.25□□□□□ -2.37
YER078W-AQ3E7A2 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.25□□□□□ -2.37
YER078W-AQ3E7A2 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.24□□□□□ -2.37
YER078W-AQ3E7A2 snR50snR50 90 nt0.22□□□□□ -2.37
YER078W-AQ3E7A2 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.21□□□□□ -2.38
YER078W-AQ3E7A2 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.21□□□□□ -2.38
YER078W-AQ3E7A2 snR81snR81 201 nt0.2□□□□□ -2.38
YER078W-AQ3E7A2 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.2□□□□□ -2.38
YER078W-AQ3E7A2 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.2□□□□□ -2.38
YER078W-AQ3E7A2 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.2□□□□□ -2.38
YER078W-AQ3E7A2 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.2□□□□□ -2.38
YER078W-AQ3E7A2 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.2□□□□□ -2.38
YER078W-AQ3E7A2 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.2□□□□□ -2.38
YER078W-AQ3E7A2 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.2□□□□□ -2.38
YER078W-AQ3E7A2 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.2□□□□□ -2.38
YER078W-AQ3E7A2 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.2□□□□□ -2.38
YER078W-AQ3E7A2 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.18□□□□□ -2.38
YER078W-AQ3E7A2 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.17□□□□□ -2.38
YER078W-AQ3E7A2 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt0.15□□□□□ -2.39
YER078W-AQ3E7A2 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt0.15□□□□□ -2.39
YER078W-AQ3E7A2 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt0.15□□□□□ -2.39
YER078W-AQ3E7A2 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt0.15□□□□□ -2.39
YER078W-AQ3E7A2 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt0.15□□□□□ -2.39
YER078W-AQ3E7A2 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt0.15□□□□□ -2.39
YER078W-AQ3E7A2 YMR326CYMR326C 309 nt0.15□□□□□ -2.39
YER078W-AQ3E7A2 snR128snR128 126 nt0.15□□□□□ -2.39
YER078W-AQ3E7A2 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.7 ms