Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdr16c6Q05A13 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdr16c6Q05A13 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdr16c6Q05A13 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdr16c6Q05A13 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdr16c6Q05A13 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdr16c6Q05A13 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdr16c6Q05A13 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdr16c6Q05A13 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdr16c6Q05A13 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdr16c6Q05A13 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdr16c6Q05A13 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdr16c6Q05A13 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdr16c6Q05A13 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sdr16c6Q05A13 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms