Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pfdn6Q03958 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfdn6Q03958 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.6 ms