Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Epb41P48193 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb41P48193 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 784.1 ms