Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmb10O35955 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms