Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ubl3Q9Z2M6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubl3Q9Z2M6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 275 ms