Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cited4Q9WUL8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cited4Q9WUL8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cited4Q9WUL8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cited4Q9WUL8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cited4Q9WUL8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cited4Q9WUL8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cited4Q9WUL8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cited4Q9WUL8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cited4Q9WUL8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cited4Q9WUL8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cited4Q9WUL8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cited4Q9WUL8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cited4Q9WUL8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cited4Q9WUL8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cited4Q9WUL8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cited4Q9WUL8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cited4Q9WUL8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms