Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Ssxb10Q6XAR7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Ssxb10Q6XAR7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssxb10Q6XAR7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Ssxb10Q6XAR7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Ssxb10Q6XAR7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Ssxb10Q6XAR7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssxb10Q6XAR7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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